GitHub et visualisation de données

Fil principalGitHub, importation et graphiques

DonnéesManchots, Excel et données ouvertes de Québec

DéfiJournal de bord et rapport GitHub

Produit fini du module

Produit final

Un dépôt GitHub lisible avec un rapport d'analyse

Le produit attendu combine un projet rangé, un journal de bord, un rapport Quarto reproductible et des messages de versionnement qui racontent le travail.

import Excel

graphique annoté

rapport rendu

commit propre graphique annoté rapport rendu

Objectifs du module

À la fin de ce module, vous devriez être capable de

Utiliser GitHub via RStudio pour cloner un dépôt, faire des commits et pousser vos changements.
Lire un fichier xlsx dans RStudio et documenter l’importation dans un rapport Quarto.
Gérer et transformer des données numériques avec dplyr (glimpse, select, mutate, filter, group_by, summarise).
Calculer et interpréter des statistiques descriptives pour des variables numériques, incluant pour des sous-groupes de données.
Visualiser des variables numériques avec ggplot2 (histogramme, boîte à moustaches, nuage de points, facettes) et interpréter les graphiques obtenus.
Améliorer la qualité de graphiques avec des titres, des légendes, des axes lisibles, des unités et une cohérence graphique.

Préparer le module

Prérequis

Vous devez savoir ouvrir un projet RStudio, rendre un fichier Quarto et utiliser les gestes de base vus au module 1. Vérifiez aussi que vous pouvez vous connecter à GitHub avant la séance.

Parcours minimal

Clonez le dépôt demandé, ouvrez le projet, importez le fichier Excel, produisez un premier graphique et faites un commit lisible. Ces cinq gestes vous préparent réellement à l’aventure.

Priorité pédagogique

Commencez par un graphique clair et un court résumé avant les facettes, les analyses secondaires ou les améliorations visuelles. Les extensions viennent après un premier rendu fonctionnel.

Dépôt et aide

Ne déposez pas de données personnelles dans GitHub. Si l’accès, le clone ou le push bloque, conservez le message d’erreur et demandez de l’aide avant de contourner le problème.

Plan d’apprentissage

Les cartes reprennent les cinq étapes du plan: lectures, aventure, défi, exercices et rétroaction avec ou sans IA. L’aventure et le défi forment le fil narratif du module. Les exercices sont autonomes et servent à consolider les gestes techniques. La rétroaction revient sur un élément du travail déjà réalisé; elle ne demande aucune remise supplémentaire.

1 Lectures à faire Préparer GitHub, l'importation Excel, dplyr et ggplot2. Mini-test Ouvrir la carteRéduire

Lectures initiales

À l'automne 2026, le module 2 est préparé pendant la semaine du 7 septembre, puis travaillé en classe le 14 septembre. Le travail préparatoire installe le dépôt GitHub, l'importation Excel et les premiers graphiques; la séance de classe sert à mettre ces gestes en pratique et à consolider l'exploration numérique et la comparaison de distributions.

Travail préparatoire

Connexion SSH entre GitHub et RStudio
Configurer le compte avec les menus et les boutons, puis vérifier la connexion.
Aide-mémoire RStudio et GitHub
Cloner un dépôt, faire des commits et pousser vers GitHub.
R4DS - Data visualization
Construire les premiers graphiques avec ggplot2.
R4DS - Data transformation
Manipuler des tableaux avec les verbes dplyr.
Documentation readxl
Importer des fichiers Excel avec read_excel().

Approfondissement

R4DS - Exploratory Data Analysis
Explorer les distributions et repérer les valeurs extrêmes.
R4DS - Spreadsheets
Comprendre les structures de données utiles dans les feuilles de calcul.
IMS - Exploring numerical data
Interpréter des résumés numériques, histogrammes et boîtes à moustaches.
Tidyverse Style Guide - ggplot2
Écrire du code graphique plus lisible.

Aide-mémoires Posit

Data import with the tidyverse :: Cheatsheet
Importation avec readr et readxl.
Data transformation with dplyr :: Cheatsheet
Verbes de transformation utilisés dans l'aventure et les exercices.
Data visualization with ggplot2 :: Cheat Sheet
Grammaire des graphiques, géométries, facettes, échelles et thèmes.

Faire le mini-test formatif des lectures.

2 Aventure Explorer les données de manchots et suivre le travail dans GitHub. Aventure Ouvrir la carteRéduire

Objectif Passer de la lecture à la pratique guidée.

Ressource Page Aventure

Action Importer les données, exécuter le code, produire les graphiques et garder les sorties importantes.

Résultat Un journal de bord que vous pouvez expliquer.

Arrêtez-vous après chaque résultat important et formulez ce qu’il montre.

3 Défi Remettre le journal de bord et un rapport d'analyse dans GitHub. Défi Ouvrir la carteRéduire

Défi

Le défi du module 2 se fait dans le même dépôt GitHub que l'aventure. Vous devez remettre le journal de bord et un rapport d'analyse Quarto sur les données des manchots.

Consulter le défi du module 2

Partie 1: compléter et rendre le journal de bord.
Partie 2: créer rapport_analyse.qmd et rendre rapport_analyse.html.
GitHub: faire plusieurs commits clairs et pousser les changements.

4 Exercices Pratiquer import, dplyr, graphiques, statistiques et cas de transfert. Exercices Ouvrir la carteRéduire

Ressource Page Exercices

Portée Ces exercices ne sont pas une étape du défi. Ils pratiquent GitHub, l'importation Excel, les graphiques et deux cas à partir de données ouvertes de Québec.

Essayez chaque exercice avant d’ouvrir la solution, surtout quand le graphique semble presque fonctionner.

5 Rétroaction Faire relire un extrait du travail, puis décider quoi améliorer soi-même. Démarche et exemples Ouvrir la carteRéduire

Rétroaction: des résumés et des graphiques vérifiables

Après une première tentative, choisissez un point à améliorer sur l'importation Excel, les résumés numériques et la visualisation. Utilisez la démarche de rétroaction avec ou sans IA; cette routine n'ajoute pas de remise aux consignes.

Une demande adaptée au module 2

Je travaille sur l'importation Excel, les résumés numériques et la visualisation. Voici la consigne, les critères pertinents et le code d'importation ou de résumé, un graphique et son interprétation. Relève un point réussi et au maximum deux améliorations, dont un choix de groupe, une unité ou une valeur manquante qui pourrait changer le résumé si les éléments fournis le montrent. Cite le passage concerné, distingue erreur observable et point à vérifier, puis propose un indice et un test. Ne réécris pas mon travail et attends ma correction.

Vérifier: Comparez le nombre d'observations et le résumé à un sous-ensemble inspecté. Vérifiez les axes, les unités et le traitement des valeurs manquantes.
Revenir sur la correction: présentez le changement et le résultat du test, puis demandez ce qui reste à vérifier.
Refaire sans aide: Expliquez un message de commit utile et justifiez le graphique choisi pour une autre question descriptive.

Sans IA, comparez votre tentative aux critères et aux exemples du cours, puis faites les mêmes vérifications. Gardez une trace courte dans la fiche de suivi, si elle vous est utile.

Confidentialité Ne transmettez aucune donnée personnelle, confidentielle ou protégée.

Données et outils

Bases de données

Télécharger le dossier de travail du module (.zip)

manchots_donnees.xlsx palmerpenguins::penguins Arbres répertoriés de Québec Compteurs cyclistes de Québec

Packages R

tidyverse palmerpenguins UlavalSSD readxl ggplot2 patchwork