RStudio ou Positron?

Choisir son environnement de travail pour le cours

Aurélien Nicosia

2026-01-01

Au programme

1. Le contexte

  • Qu’est-ce qu’un IDE ?
  • RStudio : l’incontournable
  • Positron : le nouveau venu

2. La comparaison

  • Architecture et philosophie
  • Fonctionnalités côte à côte
  • Ce que chacun fait de mieux

3. La migration

  • Les 5 changements à comprendre
  • La palette de commandes
  • Raccourcis clavier RStudio
  • Projets, Quarto, Git
  • Check-list du premier jour

4. Alors, on change ?

1. Le contexte

R, ce n’est pas un IDE

R = le langage + le moteur de calcul (l’interpréteur).

L’IDE = l’atelier autour de R : éditeur de code, console, visualisation des données, graphiques, aide, gestion de projet, Git.

On peut faire du R sans IDE (dans un terminal). On ne le fait presque jamais.

On peut donc changer d’IDE sans changer une seule ligne de code R. C’est tout l’enjeu de cette présentation.

RStudio : 15 ans de référence

  • Sorti en 2011, développé par RStudio PBC — devenu Posit en 2022.
  • Le standard de facto de l’enseignement et de la recherche en statistique.
  • Pensé de A à Z pour R : quatre panneaux, projets .Rproj, knitr, développement de packages, Shiny.
  • Open source (AGPL), disponible en desktop et en serveur.

Toujours maintenu

Posit s’engage à continuer de maintenir RStudio : sécurité, stabilité, corrections de bogues, améliorations ciblées.

Mais les grandes nouveautés vont désormais en priorité à Positron.

Positron : l’IDE de nouvelle génération

  • Annoncé par Posit en 2024, version stable en 2025.
  • Construit sur Code OSS, la base libre de VS Code.
  • Conçu pour la science des données, pas pour le développement logiciel générique : console, variables, graphiques, explorateur de données intégrés.
  • R et Python sur un pied d’égalité, dans le même outil.
  • Gratuit pour l’usage personnel, académique et commercial (licence Elastic 2.0, source-available).

En une phrase

Positron, c’est la puissance de VS Code avec les réflexes de RStudio.

Nouveautés 2026 : éditeur de notebooks, explorateur de données qui ouvre directement Excel/Parquet, panneau Connections pour les bases de données, assistant IA intégré (désactivable).

Pourquoi cette présentation ?

  • Posit oriente clairement l’avenir vers Positron.
  • Les collègues, les blogs, les formations en parlent de plus en plus.
  • Les étudiants qui font du R et du Python y gagnent immédiatement.
  • Mais RStudio reste parfaitement fonctionnel : rien ne presse.

Important

Ce cours ne vous impose pas d’outil. L’objectif est que vous sachiez choisir en connaissance de cause — et que vous ne soyez pas perdus si vous ouvrez l’autre.

2. La comparaison

Deux philosophies

RStudio Positron
Origine Écrit pour R, de zéro Fork de Code OSS (VS Code)
Langages R (+ Python via reticulate) R et Python de première classe
Interface 4 panneaux fixes, boutons dédiés Barre d’activité + panneaux flexibles
Point d’entrée Les menus et les boutons La palette de commandes
Extensions Add-ins R Marché d’extensions VS Code (des milliers)
Unité de travail Le fichier .Rproj N’importe quel dossier

Une différence structurelle : le noyau

RStudio

L’interface et la session R vivent dans le même processus.

  • Si R plante, l’IDE vacille.
  • Une seule session R à la fois.
  • Changer de version de R = redémarrer l’IDE.

Positron

L’interface parle à R via un noyau séparé (architecture Jupyter).

  • R plante ? L’IDE reste debout, on relance le noyau.
  • Plusieurs sessions R en parallèle, dans le même projet.
  • Changer de version de R : un clic dans le sélecteur d’interpréteur.

En pratique : tester le même script sous R 4.4 et R 4.5 côte à côte devient trivial.

Ce que Positron fait mieux

  • Explorateur de données : tri multi-colonnes, filtres, profil de colonne, ouverture directe de CSV, Parquet, Excel — sans écrire une ligne de code.
  • Versions de R multiples et sessions concurrentes.
  • Python natif : le même confort qu’en R (utile dès qu’un cours mélange les deux).
  • Extensions : Git Graph, correcteur orthographique, thèmes, LaTeX, Copilot…
  • Débogage plus lisible : pile d’appels et environnements séparés.
  • Travail à distance : interface locale, calcul sur un serveur.
  • Intelligence du code R : « aller à la définition », renommage, références croisées entre fichiers du projet.

Ce que RStudio fait mieux

  • Sauvegarde et restauration de l’espace de travail entre deux sessions.
  • Panneaux dédiés : Build, Profile, installation de packages — dans Positron, ces fonctions existent mais passent par la palette.
  • R Markdown et Sweave : support plus profond (Positron mise avant tout sur Quarto).
  • Add-ins RStudio : la plupart ne fonctionnent pas dans Positron ; certaines fonctions de {rstudioapi} non plus.
  • Assistant d’import de données (le bouton Import Dataset).
  • 15 ans de rodage pour l’analyse et le développement de packages en R.

Ce qui ne change pas

Votre code R fonctionne à l’identique

  • Vos scripts .R, .qmd, .Rmd
  • Vos packages (CRAN, Bioconductor, GitHub)
  • {tidyverse}, {ggplot2}, {data.table}…
  • {renv} pour la reproductibilité
  • Le rendu Quarto et R Markdown
  • Shiny : lancement et aperçu intégré
  • Git : même dépôt, mêmes commits
  • {testthat}, {devtools}, {usethis}
  • Vos fichiers .Rprofile et .Renviron
  • Le pipe |> et le raccourci pour l’insérer

Un projet R se déplace d’un IDE à l’autre sans aucune modification.

Tableau récapitulatif

Critère RStudio Positron
Prise en main débutant en R ★★★★★ ★★★★
Confort R au quotidien ★★★★★ ★★★★
Python ★★ ★★★★★
Exploration de données ★★★ ★★★★★
Développement de packages ★★★★★ ★★★★
Git ★★★ ★★★★★
Personnalisation / extensions ★★ ★★★★★
Écosystème de tutoriels francophones ★★★★★ ★★★
Stabilité des habitudes ★★★★★ ★★★

3. Migrer depuis RStudio

Les 5 changements à comprendre

  1. La palette de commandes remplace les boutons. Ctrl+Shift+P (Cmd+Shift+P sur Mac) — on tape ce qu’on veut faire.
  2. Le projet devient un dossier. Plus besoin de .Rproj (mais il reste reconnu).
  3. La barre d’activité remplace les panneaux fixes. Fichiers, recherche, Git, extensions : une icône chacun, à gauche.
  4. L’interpréteur R se choisit explicitement, en haut à droite.
  5. Tout se configure dans les Settings (Ctrl+,), pas dans un menu Options.

La palette de commandes : le réflexe n°1

Un seul raccourci à retenir pour commencer :

Ctrl + Shift + P     # Windows / Linux
Cmd  + Shift + P     # macOS

Puis on tape en langage naturel (en anglais) :

Ce que je veux Ce que je tape
Redémarrer R restart
Installer un package install
Rendre un document Quarto render
Changer de version de R interpreter
Créer un projet new project
Ouvrir les préférences settings

Retrouver ses raccourcis RStudio

Positron peut activer un jeu de raccourcis compatibles RStudio.

Comment faire : Ctrl+, → chercher rstudioKeybindings → cocher workbench.keybindings.rstudioKeybindings → redémarrer Positron.

Ou directement dans le settings.json :

{
  "workbench.keybindings.rstudioKeybindings": true
}

On retrouve alors Ctrl+1 / Ctrl+2 (éditeur / console), F2 (aller à la définition), le commentaire de bloc, etc.

Les raccourcis du quotidien

Action RStudio Positron
Exécuter la ligne / la sélection Ctrl+Entrée Ctrl+Entrée
Insérer le pipe \|> Ctrl+Maj+M Ctrl+Maj+M
Insérer un chunk Ctrl+Alt+I Ctrl+Alt+I
Aide contextuelle F1 F1
Vider la console Ctrl+L Ctrl+L
Redémarrer R Ctrl+Maj+F10 Palette → restart
Rendre le document Ctrl+Maj+K Ctrl+Maj+K
Palette de commandes — Ctrl+Maj+P
Aller à la définition F2 F2

Sur macOS, remplacer Ctrl par Cmd et Alt par Option.

Projets : du .Rproj au dossier

Avant

  1. File → New Project
  2. RStudio crée un .Rproj
  3. Ouvrir le .Rproj fixe le répertoire de travail

Maintenant

  1. File → Open Folder…
  2. Le dossier est le projet
  3. Le répertoire de travail suit le dossier ouvert

Le conseil qui ne change pas

Un dossier = un projet. Jamais de setwd() en dur. Utilisez {here} pour vos chemins : here::here("data", "notes.csv").

Quarto et les documents

  • Quarto est intégré nativement : pas d’extension à installer.
  • Le bouton Render et l’aperçu à droite fonctionnent comme dans RStudio.
  • Éditeur visuel disponible, comme le mode Visual de RStudio.
  • Les chunks R s’exécutent avec Ctrl+Entrée, avec les mêmes boutons ▶ « exécuter ce chunk » / « exécuter les chunks précédents ».
  • R Markdown (.Rmd) fonctionne aussi, mais Quarto est la voie recommandée — c’est déjà le format du cours.

Git : la vraie bonne surprise

  • Panneau Source Control dans la barre d’activité (icône branche).
  • Statut Git directement dans l’explorateur de fichiers (couleurs : modifié, nouveau, ignoré).
  • Différences côte à côte, ligne par ligne, avec possibilité de stager une portion de fichier seulement.
  • Extensions : Git Graph pour visualiser l’historique.

Pour un cours

C’est l’argument le plus convaincant après l’explorateur de données : les étudiants comprennent enfin ce qu’ils committent.

L’explorateur de données

  • Clic sur un objet dans le panneau Variables, ou :

    View(mon_tableau)

  • Tri sur plusieurs colonnes, filtres empilables.

  • Profil de colonne : distribution, valeurs manquantes, type — en un coup d’œil.

  • Ouverture directe d’un fichier .csv, .parquet, .xlsx sans l’importer dans R.

  • Fonctionne aussi sur les tibbles volumineux, sans figer la session.

Ce qui va vous manquer (soyons honnêtes)

  • Les add-ins RStudio auxquels vous tenez ({datapasta}, {styler} via le menu Addins…) — certains ont un équivalent en extension, d’autres non.
  • La console colorée qui conserve la mise en forme du code exécuté.
  • Les boutons Build / Install and Restart pour les packages : ils existent, mais via la palette ou le terminal.
  • Le réflexe de la souris : Positron récompense le clavier.
  • Deux semaines d’inconfort. C’est le prix réel de la migration.

Check-list du premier jour

  1. Installer Positron (positron.posit.co) — l’installation de R reste séparée.
  2. Ouvrir un dossier de projet existant : File → Open Folder…
  3. Vérifier l’interpréteur R en haut à droite.
  4. Activer les raccourcis RStudio (rstudioKeybindings) et redémarrer.
  5. Faire le tour guidé : palette → Welcome: Open Walkthrough.
  6. Choisir un thème et une police lisible (Ctrl+,).
  7. Ouvrir un .qmd du cours et le rendre : Ctrl+Maj+K.
  8. Installer 2-3 extensions utiles, pas 20.

4. Alors, on change ?

Ma recommandation

Restez sur RStudio si…

  • Vous débutez en R cette session et vous voulez suivre les tutoriels francophones sans friction.
  • Vous développez surtout des packages.
  • Vous dépendez d’add-ins précis.
  • Vous êtes efficaces et ça vous suffit.

Passez à Positron si…

  • Vous faites R et Python.
  • Vous manipulez de gros fichiers de données.
  • Vous voulez progresser sur Git.
  • Vous venez de VS Code.
  • Vous voulez l’outil sur lequel Posit investit.

Rien n’oblige à choisir : les deux peuvent être installés en parallèle et ouvrir le même projet.

Pour ce cours

  • Les deux IDE sont acceptés. Le code remis doit tourner dans les deux.
  • Les démonstrations indiquent les parcours équivalents dans les deux IDE quand ils diffèrent.
  • Les consignes donnent d’abord la commande à retenir, puis le bouton, le menu ou la palette de commandes utile : quarto::quarto_render(), install.packages(), renv::restore().
  • Si vous migrez, faites-le maintenant, pas la veille d’une remise.

Important

L’outil n’est pas la compétence. Ce qui compte, c’est votre code — et qu’il soit reproductible.

Pour aller plus loin

  • Site officiel de Positron — positron.posit.co
  • Guide de migration RStudio → Positron — positron.posit.co/migrate-rstudio.html
  • Comparaison officielle des fonctionnalités — positron.posit.co/migrate-rstudio-compare.html
  • Raccourcis RStudio dans Positron — positron.posit.co/migrate-rstudio-keybindings.html
  • FAQ Posit : Positron remplace-t-il RStudio ? — positron.posit.co/faqs.html
  • Notes de version mensuelles — positron.posit.co/release-notes/

Merci !

Des questions ?

Le seul mauvais choix serait de passer plus de temps à configurer son IDE qu’à écrire du R.