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Research Lab
Écosystème de recherche ouvert en statistique computationnelle, logiciels scientifiques R, science des données reproductible et pédagogie statistique.
Cette page présente l’écosystème de recherche, de logiciels scientifiques et de pédagogie ouverte développé par Aurélien Nicosia à l’Université Laval. Elle sert de porte d’entrée vers les projets GitHub, les packages R, les ressources pédagogiques et les dépôts de recherche reproductible reliés aux travaux en statistique computationnelle.
Mission
Développer une plateforme ouverte de statistique computationnelle qui relie la recherche méthodologique, les logiciels scientifiques, la science des données reproductible et l’innovation pédagogique. L’objectif est de produire des méthodes interprétables, des outils R utilisables et des ressources ouvertes qui facilitent la transmission, la vérification et la réutilisation des travaux statistiques.
Axes scientifiques
Densités et anomalies
Estimation de densité et détection d’anomalies
Méthodes d’estimation de densité fondées sur l’approche General Linear Blend Frequency Polygon, avec un intérêt pour la stabilité, l’interprétation géométrique et les diagnostics d’observations atypiques.
Données directionnelles
Statistique circulaire et directionnelle
Modèles, visualisations et outils pour les angles, orientations, directions, heures de la journée et réponses circulaires.
Mouvement animalier
Modélisation du mouvement, HMM, SSF et validation générative
Modèles de Markov cachés, fonctions de sélection de pas, modèles iSSF et validation générative de fonctions de sélection de pas pour évaluer les comportements simulés par les modèles.
Interprétation
Interprétation statistique assistée par IA
Outils et cadres de travail pour produire des explications statistiques contextualisées, avec des garde-fous méthodologiques et une attention portée à la qualité de l’interprétation.
Pédagogie ouverte
Pédagogie statistique ouverte et science des données reproductible
Ressources Quarto, jeux de données pédagogiques, tutoriels interactifs et environnements reproductibles pour l’enseignement de la statistique, de R et de la science des données.
Carte de l’écosystème
Projets phares
Densités et anomalies
GLBFP
Package R pour l’estimation de densité avec l’approche General Linear Blend Frequency Polygon. Le projet constitue le noyau méthodologique de l’axe sur les densités et les observations atypiques.
Données directionnelles
ggcircular
Extension de ggplot2 pour visualiser des données circulaires, axiales et directionnelles. Le projet soutient la diffusion graphique des méthodes pour données angulaires.
Données directionnelles
CircularRegression
Package R pour ajuster des modèles de régression circulaire-linéaire, notamment dans des contextes de données directionnelles et de trajectoires.
Mouvement animalier
Validation-SSF
Dépôt de recherche reproductible pour la validation générative de fonctions de sélection de pas, incluant des simulations, analyses empiriques et analyses de sensibilité.
Mouvement animalier
gmov
Outils de validation et diagnostics génératifs pour modèles SSF et iSSF. Le projet relie les développements méthodologiques aux diagnostics utilisables en analyse du mouvement.
Données et pédagogie
donnees-bleues
Plateforme pédagogique ouverte de jeux de données québécois pour la statistique et la science des données. Le projet fournit des données réalistes pour l’enseignement et les exercices reproductibles.
Pédagogie ouverte
tutorizeR
Package R pour convertir des documents R Markdown et Quarto en tutoriels interactifs learnr, avec exercices, solutions et questionnaires facultatifs.
Projet émergent
contextR
Projet émergent autour d’explications statistiques contextualisées en R, avec structures S3, garde-fous et liens avec l’interprétation statistique assistée par IA.
Logiciels scientifiques
Les packages R forment une couche centrale de l’écosystème. Ils transforment les idées méthodologiques en outils testables, documentables et réutilisables. Les projets GLBFP, ggcircular, CircularRegression, gmov, tutorizeR et contextR couvrent respectivement l’estimation de densité, la visualisation circulaire, la modélisation de réponses circulaires, la validation générative du mouvement, la production de tutoriels interactifs et l’interprétation statistique contextualisée.
Données et pédagogie
Les ressources pédagogiques visent à soutenir une formation ouverte, réaliste et reproductible en statistique et science des données.
Jeux de données
donnees-bleues rassemble des jeux de données québécois utilisables dans les cours, les exercices et les projets.
Cours et modules
Les sites de cours et de ressources structurent les contenus en statistique, R et science des données.
Tutoriels interactifs
tutorizeR soutient la transformation de documents reproductibles en ressources interactives pour l’enseignement.
Recherche reproductible
Les dépôts de recherche reproductible documentent le code, les analyses, les figures, les simulations et les matériaux associés aux travaux scientifiques. Cette couche rend les résultats plus vérifiables et facilite la réutilisation par des collaborateurs, étudiants, lecteurs d’articles et utilisateurs de logiciels scientifiques.
Collaborations et contact
Les collaborations sont bienvenues sur les méthodes statistiques, les logiciels R, les applications en écologie du mouvement, les données directionnelles, la pédagogie statistique et la science des données reproductible.